Der Begriff Hauptstadtzoo (auch: Berliner Zoo) bezeichnet die seit dem 31. Januar 2007 gemeinsam verwalteten beiden großen Zoos in Berlin, das sind:
der 1844 eröffnete Zoologische Garten auf dem Gelände der königlichen Fasanerie
er wurde am 18. August 1913 um das Berliner Aquarium erweiterter 1955 eröffnete Tierpark Berlin in Friedrichsfelde
Während der Zeit der Berliner Teilung war der in West-Berlin gelegene Zoologische Garten von Ost-Berlin aus nicht zugänglich. Nach der deutschen Wiedervereinigung gab es dann eine erste Kooperation zwischen beiden Zoos.
Als gemeinsame Organisationen gibt es den Förderverein Gemeinschaft der Förderer von Tierpark Berlin und Zoologischem Garten Berlin (auch „Freunde Hauptstadtzoos“) mit der Akademie Hauptstadtzoos[3] und die Stiftung der Freunde der Hauptstadtzoos.